Package: MultivariateAnalysis 0.5.1

Alcinei Mistico Azevedo

MultivariateAnalysis: Pacote Para Analise Multivariada

Package with multivariate analysis methodologies for experiment evaluation. The package estimates dissimilarity measures, builds dendrograms, obtains MANOVA, principal components, canonical variables, etc. (Pacote com metodologias de analise multivariada para avaliação de experimentos. O pacote estima medidas de dissimilaridade, construi de dendogramas, obtem a MANOVA, componentes principais, variaveis canonicas, etc.)

Authors:Alcinei Mistico Azevedo [aut, cre]

MultivariateAnalysis_0.5.1.tar.gz
MultivariateAnalysis_0.5.1.tar.gz(r-4.7-any)MultivariateAnalysis_0.5.1.tar.gz(r-4.6-any)
MultivariateAnalysis_0.5.1.tgz(r-4.6-emscripten)
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DESCRIPTION |NEWS
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MultivariateAnalysis/json (API)

# Install 'MultivariateAnalysis' in R:
install.packages('MultivariateAnalysis', repos = c('https://cran.r-universe.dev', 'https://cloud.r-project.org'))
Datasets:
  • Dados.BIN - Dados de exemplo (Dados binarios).
  • Dados.CAT - Exemplo de dados qualitativos multicategoricos.
  • Dados.DBC - Dados de exemplo de um experimento em DBC.
  • Dados.DBC.Misto - Dados de exemplo de um experimento em DBC com dados quantitativos e mistos.
  • Dados.DIC - Dados de exemplo de um experimento em DIC.
  • Dados.DQL - Dados de exemplo de um experimento em DQL.
  • Dados.Fat2.DBC - Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DBC.
  • Dados.Fat2.DIC - Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DIC.
  • Dados.Fat3.DBC - Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DBC.
  • Dados.Fat3.DIC - Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DIC.
  • Dados.FMI.Quali - Exemplo de dados qualitativos multicategoricos em um experimento com progenies de meios irmaos.
  • Dados.FMI.Quanti - Exemplo de dados quantitativos em um experimento com progenies de meios irmaos.
  • Dados.MED - Dados de um exemplo com variaveis quantitativas.
  • Dados.Misto - Dados de exemplo de um experimento com dados mistos.

On CRAN:

Conda:

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3.53 score 38 scripts 409 downloads 25 exports 148 dependencies

Last updated from:4f6563f8f3. Checks:4 OK. Indexed: yes.

TargetResultTimeFilesSyslog
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source / vignettesOK260
linux-release-x86_64OK200
wasm-releaseOK187

Exports:AnovaClusterApplyDissimilaridadeComponentesPrincipaisComponentesPrincipais.MistoContribuicaoRelativaCoordenadasPrincipaisCorrelacaoMantelDendrogramaDendrograma_NumeroOtimoDistanciaHeatPlotKmeansKmeans_NumeroOtimoKmeans_NumeroOtimo2MANOVAMediaDistanciaMulticolinearidadeNormatizaPairCompplot3dQuant2Qualisetwd_scriptSummaryDistanciaTocherVariaveisCanonicas

Dependencies:abindaskpassbackportsbase64encbiotoolsbootbroombslibcachemcandisccarcarDatacliclustercolorspacecommonmarkcorrplotcowplotcpp11crayoncrosstalkcurldata.tabledendextendDerivdigestdoBydplyrDTecodistellipseemmeansestimabilityevaluatefactoextraFactoMineRfarverfastmapflashClustfontawesomeforecastFormulafracdifffsgenericsggdendroggplot2ggpubrggrepelggsciggsignifggtextgluegridExtragridtextgtableheplotshighrhtmltoolshtmlwidgetshttrigraphinsightirlbaisobandjpegjquerylibjsonliteknitrlabelinglaterlatticelazyevalleapslifecyclelitedownlme4lmtestmagrittrmarkdownMASSMatrixMatrixModelsmemoisemgcvmimeminqamodelrmultcompViewmvtnormNbClustnlmenloptrnnetnumDerivopensslotelpbkrtestPCAmixdatapillarpkgconfigplotlypngpolynompromisespurrrquantregR6rappdirsrbibutilsRColorBrewerRcppRcppArmadilloRcppEigenRdpackreformulasrglrlangrmarkdownrstatixrstudioapiS7sassscalesscatterplot3dshowtextshowtextdbSparseMstringistringrsurvivalsyssysfontstibbletidyrtidyselecttimeDatetinytexurcautf8vctrsviridisviridisLitewithrxfunxml2yamlzoo

Exemplo: dados multicategóricos
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dados qualitativos (binários ou multicategóricos)
Rendered fromExemplo_dados_multicategoricos.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2024-04-09
Started: 2021-08-05

Exemplo: esquema fatorial no DBC
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Analise de variancia Multivariada | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dados quantitativos: | Outra possibilidade é o estudo dos componentes principais: | Porém, quando se tem repetições, o mais indicado é o estudo de variáveis canônicas:
Rendered fromExemplo_dados_quantitativos_FAT_DBC.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2024-04-09
Started: 2021-08-05

Exemplo: Experimento com dados mistos sem repetições
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Obtenção de medidas de dissimilaridade para dados mistos | Método 1: Índice de Gower | Método 2: Índice de Gower 2 | Método 3: Calcular a medida de dissimilaridade mais apropriada para cada variável e fazer a média ponderada posteriormente. | Metodo 4: Transformar os dados quantitativos em qualitativos e considerar tudo como multicategórico | Após obter a matriz de dissimilaridade, podemos fazer o Dendrograma. | Para comparar as metodologias pode-se estimar a correlação dos metodos dois a dois | Uma opção de biplot legal para dados mistos é o PCAmixed.
Rendered fromExemplo_dados_misto.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2024-04-09
Started: 2021-08-05

Exemplo: Experimento em DBC
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Analise de variancia Multivariada | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dados quantitativos:
Rendered fromExemplo_dados_quantitativos_DBC.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2024-04-09
Started: 2021-08-05

Exemplo: Experimento em DBC com dados Mistos
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Analise de variancia Multivariada | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dissimilaridade para os dados quantitativos: | Dissimilaridade para os dados qualitativos: | Opções de medidas para dados qualitativos | Obtendo a média ponderada das matrizes de dissimilaridade | Obtendo Dendrograma para as 3 medidas de dissimilaridade | Estimativas de correção entre as medidas de dissimilaridade
Rendered fromExemplo_dados_DBC_Misto.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2024-04-09
Started: 2021-08-05

Exemplo: Experimento em em DIC
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Analise de variancia Multivariada | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dados quantitativos:
Rendered fromExemplo_dados_quantitativos_DIC.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2024-04-09
Started: 2021-08-05

Exemplo: Experimento sem repetições
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dados quantitativos
Rendered fromExemplo_dados_quantitativos_Med.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2024-04-09
Started: 2021-08-05

Exemplo: dados binários
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dados qualitativos (binários ou multicategóricos) | Dados qualitativos binarios
Rendered fromExemplo_dados_binarios.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2021-11-12
Started: 2021-08-05

Exemplo: dados qualitativos em FMI
Ativando o pacote | Abrindo o conjunto de dados | Obtenção de medidas de dissimilaridade | Dados quantitativos
Rendered fromExemplo_dados_Qualitativos_FMI.Rmdusingknitr::rmarkdown

Last update: 2021-11-12
Started: 2021-08-05

Readme and manuals

Help Manual

Help pageTopics
Analise de variancia considerando clustersAnovaCluster
ApplyDissimilaridadeApplyDissimilaridade
Componentes principaisComponentesPrincipais
Componentes principais para dados mistos (qualitativos e quantitativos)ComponentesPrincipais.Misto
Contribuicao das variaveis independentes para o agrupamentoContribuicaoRelativa
Estudo de coordenadas principaisCoordenadasPrincipais
Estimacao da correlacao e significancia pelo metodo Mantel.CorrelacaoMantel
Dados de exemplo (Dados binarios).Dados.BIN
Exemplo de dados qualitativos multicategoricos.Dados.CAT
Dados de exemplo de um experimento em DBC.Dados.DBC
Dados de exemplo de um experimento em DBC com dados quantitativos e mistos.Dados.DBC.Misto
Dados de exemplo de um experimento em DIC.Dados.DIC
Dados de exemplo de um experimento em DQL.Dados.DQL
Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DBC.Dados.Fat2.DBC
Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DIC.Dados.Fat2.DIC
Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DBC.Dados.Fat3.DBC
Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DIC.Dados.Fat3.DIC
Exemplo de dados qualitativos multicategoricos em um experimento com progenies de meios irmaos.Dados.FMI.Quali
Exemplo de dados quantitativos em um experimento com progenies de meios irmaos.Dados.FMI.Quanti
Dados de um exemplo com variaveis quantitativas.Dados.MED
Dados de exemplo de um experimento com dados mistos.Dados.Misto
DendrogramaDendrograma
Determinacao do numero otimo de clusters no dendrogramaDendrograma_NumeroOtimo
Distancia de dissimilaridadeDistancia
Grafico de calor para a interpretacao do DendrogramaHeatPlot
Agrupamento K-meansKmeans
Numero otimo de clustersKmeans_NumeroOtimo
Numero otimo de clusters pelo metodo do cotoveloKmeans_NumeroOtimo2
Analise de variancia multivariadaMANOVA
Media ponderada entre as matrizes de dissimilaridadeMediaDistancia
Diagnostico de multicolinearidadeMulticolinearidade
Pacote Para Analise De Experimentos Com Abordagem MultivariadaMultivariateAnalysis MultivariateAnalysis package
Normatiza a matriz para que os valores variem entre valores pre-estabelecidos.Normatiza
Comparacoes multiplas multivariadasPairComp
Grafico com tres dimensoesplot3d
Transformar dados quantitativos em qualitativosQuant2Quali
Definir o diretório do script working directory (Set the script Directory as working directory).setwd_script
Resumo das informacoes de cada tratamento em funcao da dissimilaridadeSummaryDistancia
Agrupamento TocherTocher
Analise de variaveis canonicasVariaveisCanonicas