Package: MultivariateAnalysis 0.5.0

Alcinei Mistico Azevedo

MultivariateAnalysis: Pacote Para Analise Multivariada

Package with multivariate analysis methodologies for experiment evaluation. The package estimates dissimilarity measures, builds dendrograms, obtains MANOVA, principal components, canonical variables, etc. (Pacote com metodologias de analise multivariada para avaliação de experimentos. O pacote estima medidas de dissimilaridade, construi de dendogramas, obtem a MANOVA, componentes principais, variaveis canonicas, etc.)

Authors:Alcinei Mistico Azevedo [aut, cre]

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# Install 'MultivariateAnalysis' in R:

install.packages('MultivariateAnalysis', repos = c('https://cran.r-universe.dev', 'https://cloud.r-project.org'))

Datasets:

Dados.BIN - Dados de exemplo (Dados binarios).
Dados.CAT - Exemplo de dados qualitativos multicategoricos.
Dados.DBC - Dados de exemplo de um experimento em DBC.
Dados.DBC.Misto - Dados de exemplo de um experimento em DBC com dados quantitativos e mistos.
Dados.DIC - Dados de exemplo de um experimento em DIC.
Dados.DQL - Dados de exemplo de um experimento em DQL.
Dados.FMI.Quali - Exemplo de dados qualitativos multicategoricos em um experimento com progenies de meios irmaos.
Dados.FMI.Quanti - Exemplo de dados quantitativos em um experimento com progenies de meios irmaos.
Dados.Fat2.DBC - Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DBC.
Dados.Fat2.DIC - Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DIC.
Dados.Fat3.DBC - Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DBC.
Dados.Fat3.DIC - Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DIC.
Dados.MED - Dados de um exemplo com variaveis quantitativas.
Dados.Misto - Dados de exemplo de um experimento com dados mistos.

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Exports:AnovaCluster ApplyDissimilaridade ComponentesPrincipais ComponentesPrincipais.Misto ContribuicaoRelativa CoordenadasPrincipais CorrelacaoMantel Dendrograma Dendrograma_NumeroOtimo Distancia HeatPlot Kmeans Kmeans_NumeroOtimo Kmeans_NumeroOtimo2 MANOVA MediaDistancia Multicolinearidade Normatiza PairComp plot3d Quant2Quali setwd_script SummaryDistancia Tocher VariaveisCanonicas

Dependencies:abind askpass backports base64enc biotools boot broom bslib cachem candisc car carData cli cluster colorspace corrplot cowplot cpp11 crayon crosstalk curl data.table dendextend Deriv digest doBy dplyr DT ecodist ellipse emmeans estimability evaluate factoextra FactoMineR fansi farver fastmap flashClust fontawesome fs generics ggdendro ggplot2 ggpubr ggrepel ggsci ggsignif glue gridExtra gtable heplots highr htmltools htmlwidgets httpuv httr igraph isoband jquerylib jsonlite knitr labeling later lattice lazyeval leaps lifecycle lme4 magrittr MASS Matrix MatrixModels memoise mgcv microbenchmark mime minqa modelr multcompView munsell mvtnorm NbClust nlme nloptr nnet numDeriv openssl pbkrtest PCAmixdata pillar pkgconfig plotly plyr polynom promises purrr quantreg R6 rappdirs RColorBrewer Rcpp RcppEigen reshape2 rgl rlang rmarkdown rstatix rstudioapi sass scales scatterplot3d SparseM stringi stringr survival sys tibble tidyr tidyselect tinytex utf8 vctrs viridis viridisLite withr xfun yaml

Exemplo: dados binários

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Exemplo: dados multicategóricos

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Exemplo: dados qualitativos em FMI

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Exemplo: esquema fatorial no DBC

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Exemplo: Experimento com dados mistos sem repetições

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Exemplo: Experimento em DBC

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Exemplo: Experimento em DBC com dados Mistos

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Exemplo: Experimento em em DIC

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Exemplo: Experimento sem repetições

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Help page	Topics
Analise de variancia considerando clusters	AnovaCluster
ApplyDissimilaridade	ApplyDissimilaridade
Componentes principais	ComponentesPrincipais
Componentes principais para dados mistos (qualitativos e quantitativos)	ComponentesPrincipais.Misto
Contribuicao das variaveis independentes para o agrupamento	ContribuicaoRelativa
Estudo de coordenadas principais	CoordenadasPrincipais
Estimacao da correlacao e significancia pelo metodo Mantel.	CorrelacaoMantel
Dados de exemplo (Dados binarios).	Dados.BIN
Exemplo de dados qualitativos multicategoricos.	Dados.CAT
Dados de exemplo de um experimento em DBC.	Dados.DBC
Dados de exemplo de um experimento em DBC com dados quantitativos e mistos.	Dados.DBC.Misto
Dados de exemplo de um experimento em DIC.	Dados.DIC
Dados de exemplo de um experimento em DQL.	Dados.DQL
Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DBC.	Dados.Fat2.DBC
Dados de um experimento em esquema fatorial duplo conduzido em DIC.	Dados.Fat2.DIC
Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DBC.	Dados.Fat3.DBC
Dados de um experimento em esquema fatorial triplo conduzido em DIC.	Dados.Fat3.DIC
Exemplo de dados qualitativos multicategoricos em um experimento com progenies de meios irmaos.	Dados.FMI.Quali
Exemplo de dados quantitativos em um experimento com progenies de meios irmaos.	Dados.FMI.Quanti
Dados de um exemplo com variaveis quantitativas.	Dados.MED
Dados de exemplo de um experimento com dados mistos.	Dados.Misto
Dendrograma	Dendrograma
Determinacao do numero otimo de clusters no dendrograma	Dendrograma_NumeroOtimo
Distancia de dissimilaridade	Distancia
Grafico de calor para a interpretacao do Dendrograma	HeatPlot
Agrupamento K-means	Kmeans
Numero otimo de clusters	Kmeans_NumeroOtimo
Numero otimo de clusters pelo metodo do cotovelo	Kmeans_NumeroOtimo2
Analise de variancia multivariada	MANOVA
Media ponderada entre as matrizes de dissimilaridade	MediaDistancia
Diagnostico de multicolinearidade	Multicolinearidade
Pacote Para Analise De Experimentos Com Abordagem Multivariada	MultivariateAnalysis MultivariateAnalysis package
Normatiza a matriz para que os valores variem entre valores pre-estabelecidos.	Normatiza
Comparacoes multiplas multivariadas	PairComp
Grafico com tres dimensoes	plot3d
Transformar dados quantitativos em qualitativos	Quant2Quali
Definir o diretório do script working directory (Set the script Directory as working directory).	setwd_script
Resumo das informacoes de cada tratamento em funcao da dissimilaridade	SummaryDistancia
Agrupamento Tocher	Tocher
Analise de variaveis canonicas	VariaveisCanonicas

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Exemplo: Experimento com dados mistos sem repetições

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