Package 'Tratamentos.ad'

Title: Pacote Para Analise De Experimentos Com Testemunhas Adicionais
Description: Pacote para a analise de experimentos com um ou dois fatores com testemunhas adicionais conduzidos no delineamento inteiramente casualizado ou em blocos casualizados. "Package for the analysis of one or two-way experiments with additional controls conducted in a completely randomized design or in a randomized block design".
Authors: Alcinei Mistico Azevedo [aut, cre]
Maintainer: Alcinei Mistico Azevedo <[email protected]>
License: GPL-3
Version: 0.2.4
Built: 2026-05-19 07:29:05 UTC
Source: https://github.com/cran/Tratamentos.ad

Help Index

Tratamentos.ad: Pacote Para Analise De Experimentos Com Testemunhas

Description

Tratamentos.ad: realiza a analise de experimentos com unifatorial ou fatorial contendo uma ou mais testemunhas adicionais. Para os fatores quantitativos e feita a analise de regressao, ja para os fatores qualitativos sao feitos testes de comparacao multipla. Para comparar os tratamentos testemunhas com os demais e utilizado o teste Dunnett.

Details

Este pacote realiza a analise de experimentos com unifatorial ou fatorial contendo uma ou mais testemunhas

References

Canal no youtube -> Alcinei Azevedo - Dicas e aulas <https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

BANZATTO, D. A.; KRONKA, S. N. Experimentacao Agricola. 4 ed. Jaboticabal: Funep. 2006. 237 p.

GOMES, F. P. Curso de Estatistica Experimental. 10a ed. Piracicaba: ESALQ/USP. 1982. 430.

See Also

dic.ad, dbc.ad, fatorial2.ad.dic, fatorial2.ad.dbc

Dados de exemplo (1 fator e 1 testemunha).

Description

Exemplo simulado de um experimento com um fator qualitativo, uma testemunha adicional e 4 repeticoes. "Simulated example of an experiment with an qualitative factor, additional control and 4 repetitions".

Usage

data(Dados1)

Format

Um data frame com 20 observacoes das seguintes variaveis.

Test

Vetor do tipo Fator.

Espacamento

Vetor do tipo Fator.

Rep

Vetor numerico.

Prod

Vetor numerico.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Dados de exemplo (1 fator e 3 testemunhas).

Description

Exemplo simulado de um experimento com um fator quantitativo e tres testemunhas adicionais e 4 repeticoes. "Simulated example of an experiment with an quantitative factor, 3 additional controls and 4 repetitions".

Usage

data(Dados2)

Format

Um data frame com 28 observacoes das seguintes variaveis.

Test

Vetor do tipo Fator.

Dose

Vetor do tipo numerico.

Rep

Vetor numerico.

Prod

Vetor numerico.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Dados de exemplo (2 fatores e 2 testemunhas).

Description

Exemplo simulado de um experimento com dois fatores qualitativos, duas testemunhas adicionais e duas repeticoes."Simulated example of an experiment with an 2 qualitative factors, additionals controls and 4 repetitions".

Usage

data(Dados3)

Format

Um data frame com 28 observacoes das seguintes variaveis.

Testemunha

Vetor do tipo Fator.

FatorA

Vetor do tipo Fator.

FatorB

Vetor do tipo Fator.

Rep

Vetor do tipo numerico

NumeroFrutos

Vetor numerico.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Dados de exemplo (2 fatores e 1 testemunha).

Description

Exemplo simulado de um experimento com dois fatores um quantitativo e o outro qualitativo, uma testemunha e quatro repeticoes."Simulated example of an experiment with an qualitative and quantitative factors, additional control and 4 repetitions".

Usage

data(Dados4)

Format

Um data frame com 36 observacoes das seguintes variaveis.

Test

Vetor do tipo Fator.

Doses

Vetor do tipo quantitativo.

Cultivar

Vetor do tipo Fator.

Rep

Vetor do tipo numerico

Prod

Vetor numerico.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Dados de exemplo (2 fatores e 3 testemunha).

Description

Exemplo simulado de um experimento com dois fatores um quantitativo e o outro qualitativo, uma testemunha e quatro repeticoes."Simulated example of an experiment with qualitative and quantitative factors, additional control and 4 repetitions".

Usage

data(Dados5)

Format

Um data frame com 44 observacoes das seguintes variaveis.

Test

Vetor do tipo Fator.

Cultivar

Vetor do tipo quantitativo.

Doses

Vetor do tipo Fator.

Rep

Vetor do tipo numerico

Prod

Vetor numerico.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Dados de exemplo (3 fatores e 3 testemunha).

Description

Exemplo simulado de um experimento com tres fatores qualitativos, uma testemunha e quatro repeticoes. "Simulated example of an experiment with 3 qualitative factors, additional control and 4 repetitions".

Usage

data(Dados6)

Format

Um data frame com 76 observacoes das seguintes variaveis.

Test

Vetor do tipo Fator.

Cultivar

Vetor do tipo quantitativo.

Espacamento

Vetor do tipo Fator.

Adubacao

Vetor do tipo Fator.

Rep

Vetor do tipo numerico

Prod

Vetor numerico.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Dados de exemplo de DQL (4 tratamentos comuns e 2 testemunhas).

Description

Exemplo simulado de um experimento em DQL com quatro tratamentos comuns qualitativos e duas testemunhas.

Usage

data(Dados7)

Format

Um data frame com 36 observacoes das seguintes variaveis.

Test

Vetor do tipo Fator.

Medicamento

Vetor com os tratamentos.

Animal

Vetor com a identificao das linhas.

Epoca

Vetor com a identificacao das colunas.

Carrapato

Vetor do tipo numerico com a variavel resposta.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Dados de exemplo de DQL (5 tratamentos comuns e 1 testemunha).

Description

Exemplo simulado de um experimento em DQL com cinco tratamentos comuns quantitativos e uma testemunha.

Usage

data(Dados8)

Format

Um data frame com 36 observacoes das seguintes variaveis.

Test

Vetor do tipo Fator.

Medicamento

Vetor numerico com os tratamentos quantitativos.

Animal

Vetor com a identificao das linhas.

Epoca

Vetor com a identificacao das colunas.

Carrapato

Vetor do tipo numerico com a variavel resposta.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

Analise de experimento conduzido no delineamento em blocos casualizados com testemunhas adicionais

Description

Esta funcao retorna a comparacao multipla de medias (obtidas pelos testes t, t com protecao de Bonferroni, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey e Scott-Knott) se os tratamentos for qualitativos. Ou a analise de regressao se os tratamentos forem quantitativos. Para comparar a testemunha adicional com os demais e utilizado o teste Dunnet. Esta funcao considera o delineamento em blocos casualizados. "This function returns the multiple comparison tests (t, t tests with Bonferroni protection, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey and Scott-Knott ) if the treatments are qualitative. Or regression analysis if treatments are quantitative. To compare the additional control with the others treatments, the Dunnet test is used. This function considers the randomized block design."

Usage

dbc.ad(Dados,alfa=0.05,quali=TRUE,verbose=TRUE,plot=2)

Arguments

Dados

Matriz contendo na primeira coluna a identificacao dos testemunhas (tratamentos comuns deve ter valor zero ou NA). A segunda coluna deve ter a identificacao de todos os tratamentos. A terceira coluna a identificacao dos blocos. A quarta coluna a variavel resposta.
alfa

valor indicando o nivel de significancia deve ser obrigatoriamente "0.001", "0.01", "0.05" ou "0.10" (default = 0.05).
quali

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE indica que o tratamento e qualitativo, realizando-se o teste de medias. FALSE indica que o fator e quantitativo, sendo feita a analise de regressao.
verbose

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE apresenta os resultados da analise.
plot

Valor numerico indicando o grafico desejado para analise dos residuos:

  • 1: Residuals vs Fitted

  • 2: QQ-plot

  • 3: Scale-Location

  • 4: Cook's distance

  • 5: Histogram

Value

Retorna a comparacao multipla de medias obtida por varios testes.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

BANZATTO, D. A.; KRONKA, S. N. Experimentacao Agricola. 4 ed. Jaboticabal: Funep. 2006. 237 p.

GOMES, F. P. Curso de Estatistica Experimental. 10a ed. Piracicaba: ESALQ/USP. 1982. 430.

Examples

######
 #Exemplo de um experimento em DBC com tratamentos qualitativos e uma
 #testemunha adicional
 data(Dados1)
 dbc.ad(Dados = Dados1,alfa = 0.05,quali =TRUE)
 #Exemplo de um experimento em DBC com tratamentos quantitativos e tres
 #testemunhas adicionais
data(Dados2)
dbc.ad(Dados = Dados2,alfa = 0.05,quali =FALSE)

Analise de experimento conduzido no delineamento inteiramente casualizado com testemunhas adicionais

Description

Esta funcao retorna a comparacao multipla de medias (obtidas pelos testes t, t com protecao de Bonferroni, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey e Scott-Knott) se os tratamentos for qualitativos. Ou a analise de regressao se os tratamentos forem quantitativos. Para comparar a testemunha adicional com os demais e utilizado o teste Dunnet. Esta funcao considera o delineamento inteiramente casualizado. "This function returns the multiple comparison tests (t, t tests with Bonferroni protection, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey and Scott-Knott ) if the treatments are qualitative. Or regression analysis if treatments are quantitative. To compare the additional control with the others treatments, the Dunnet test is used. This function considers the completely randomized design."

Usage

dic.ad(Dados,alfa=0.05,quali=TRUE,verbose=TRUE,plot=2)

Arguments

Dados

Matriz contendo na primeira coluna a identificacao dos tratamentos testemunhas (tratamentos comuns deve ter valor zero ou NA). A segunda coluna deve ter a identificacao de todos os tratamentos. A terceira coluna a identificacao das repeticoes. Na quarta coluna os resultados experimentais.
alfa

valor indicando o nivel de significancia. Deve ser obrigatoriamente "0.001", "0.01", "0.05" ou "0.10" (default = 0.05).
quali

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE indica que o Tratamento e qualitativo, realizando-se o teste de medias. FALSE indica que o fator e quantitativo, sendo feita a analise de regressao.
verbose

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE apresenta os resultados da analise.
plot

Valor numerico indicando o grafico desejado para analise dos residuos:

  • 1: Residuals vs Fitted

  • 2: QQ-plot

  • 3: Scale-Location

  • 4: Cook's distance

  • 5: Histogram

Value

Retorna a comparacao multipla de medias obtida por varios testes.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

BANZATTO, D. A.; KRONKA, S. N. Experimentacao Agricola. 4 ed. Jaboticabal: Funep. 2006. 237 p.

GOMES, F. P. Curso de Estatistica Experimental. 10a ed. Piracicaba: ESALQ/USP. 1982. 430.

Examples

######
 #Exemplo de um experimento em DIC com tratamentos qualitativos e uma
 #testemunha adicional
 data(Dados1)
 dic.ad(Dados = Dados1,alfa = 0.05,quali =TRUE)
 #Exemplo de um experimento em DIC com tratamentos quantitativos e tres
 #testemunhas adicionais
data(Dados2)
dic.ad(Dados = Dados2,alfa = 0.05,quali =FALSE)

Analise de experimento conduzido no delineamento em quadrado latino com testemunhas adicionais

Description

Esta funcao retorna a comparacao multipla de medias (obtidas pelos testes t, t com protecao de Bonferroni, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey e Scott-Knott) se os tratamentos for qualitativos. Ou a analise de regressao se os tratamentos forem quantitativos. Para comparar a testemunha adicional com os demais e utilizado o teste Dunnet. Esta funcao considera o delineamento em quadrados latinos.

Usage

dql.ad(Dados,alfa=0.05,quali=TRUE,verbose=TRUE,plot=2)

Arguments

Dados

Matriz contendo na primeira coluna a identificacao dos testemunhas (tratamentos comuns deve ter valor zero ou NA). A segunda coluna deve ter a identificacao de todos os tratamentos. A terceira coluna a identificacao dos linhas. A quarta coluna a identificacao das colunas. A quinta coluna a variavel resposta.
alfa

valor indicando o nivel de significancia deve ser obrigatoriamente "0.001", "0.01", "0.05" ou "0.10" (default = 0.05).
quali

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE indica que o tratamento e qualitativo, realizando-se o teste de medias. FALSE indica que o fator e quantitativo, sendo feita a analise de regressao.
verbose

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE apresenta os resultados da analise.
plot

Valor numerico indicando o grafico desejado para analise dos residuos:

  • 1: Residuals vs Fitted

  • 2: QQ-plot

  • 3: Scale-Location

  • 4: Cook's distance

  • 5: Histogram

Value

Retorna a comparacao multipla de medias obtida por varios testes.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

BANZATTO, D. A.; KRONKA, S. N. Experimentacao Agricola. 4 ed. Jaboticabal: Funep. 2006. 237 p.

GOMES, F. P. Curso de Estatistica Experimental. 10a ed. Piracicaba: ESALQ/USP. 1982. 430.

Examples

######
 #Exemplo de um experimento em DQL com tratamentos qualitativos e duas
 #testemunhas adicionais
 ?dql.ad
 data(Dados7)
 dql.ad(Dados = Dados7,alfa = 0.05,quali =TRUE)
 #Exemplo de um experimento em DQL com tratamentos quantitativos e uma
 #testemunha adicional
 data(Dados8)
 dql.ad(Dados = Dados8,alfa = 0.05,quali =FALSE)

Analise de experimento fatorial duplo com testemunhas no DBC

Description

Esta funcao considera experimentos em esquema fatorial no delineamento em blocos casualizados.Esta funcao retorna a comparacao multipla de medias (obtidas pelos testes t, t com protecao de Bonferroni, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey e Scott-Knott) se o fator for qualitativo. Ou a analise de regressao se o fator for quantitativo. Para comparar a testemunha adicional com os demais e utilizado o teste Dunnet. "This function considers experiments in factorial scheme for the randomized block design. This function returns the multiple comparison tests ( t, t with Bonferroni protection, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey and Scott-Knott) if the factor is qualitative. Or regression analysis if the factor is quantitative. To compare the additionals controls with the others treatments, the Dunnet test is used."

Usage

fatorial2.ad.dbc(Dados,Protegido=FALSE,alfa=0.05,quali=c(TRUE,TRUE),verbose=TRUE,plot=2)

Arguments

Dados

Matriz contendo na primeira coluna a identificacao das testemunhas (tratamentos comuns deve ter valor "NA" ou zero). A segunda coluna deve ter a identificacao dos niveis do primeiro fator. A terceira coluna a identificacao dos niveis do segundo fator. A quarta coluna a identificacao das repeticoes (Blocos). Na quinta coluna os resultados da variavel resposta.
Protegido

Valor logico. Se for FALSE os testes de medias serao feitos indendente das significancias pelo teste F na ANOVA.Se for TRUE os testes de medias serao feitas apenas quando haver efeito significativo pelo teste F.
alfa

valor indicando o nivel de significancia deve ser obrigatoriamente "0.001", "0.01", "0.05" ou "0.10" (default = 0.05).
quali

Vetor com dois valores logicos (TRUE/FALSE). TRUE indica que o respectivo fator e qualitativo, realizando-se o teste de medias. FALSE indica que o fator e quantitativo, sendo feita a analise de regressao.
verbose

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE apresenta os resultados da analise.
plot

Valor numerico indicando o grafico desejado para analise dos residuos:

  • 1: Residuals vs Fitted

  • 2: QQ-plot

  • 3: Scale-Location

  • 4: Cook's distance

  • 5: Histogram

Value

Retorna a comparacao multipla de medias obtida por varios testes para tratamentos qualitativos e regressao para testes quantitativos. O teste Dunnet e feito para comparar os tratamentos testemunhas com os demais.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

<https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

BANZATTO, D. A.; KRONKA, S. N. Experimentacao Agricola. 4 ed. Jaboticabal: Funep. 2006. 237 p.

GOMES, F. P. Curso de Estatistica Experimental. 10a ed. Piracicaba: ESALQ/USP. 1982. 430.

Examples

##Exemplo de experimento com duas testemunhas adicionais e fatores qualitativos

data(Dados3)
fatorial2.ad.dbc(Dados3,Protegido=FALSE,alfa = 0.05,quali = c(TRUE,TRUE))

##Exemplo de experimento com uma testemunha adicional e um fator qualitativo
data(Dados4)
fatorial2.ad.dbc(Dados4,Protegido=TRUE,alfa = 0.05,quali = c(FALSE,TRUE))

##Exemplo de experimento com tres testemunhas adicionais e um fator qualitativo
data(Dados5)
fatorial2.ad.dbc(Dados5,Protegido=TRUE,alfa = 0.05,quali = c(TRUE,FALSE))

Analise de experimento em esquema fatorial duplo com testemunhas em DIC

Description

Esta funcao considera experimentos em esquema fatorial no delineamento inteiramente casualizado.Esta funcao retorna a comparacao multipla de medias (obtidas pelos testes t, t com protecao de Bonferroni, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey e Scott-Knott) se o fator for qualitativo. Ou a analise de regressao se o fator for quantitativo. Para comparar a testemunha adicional com os demais e utilizado o teste Dunnet. "This function considers experiments in factorial scheme for the completely randomized design. This function returns the multiple comparison tests ( t, t with Bonferroni protection, Duncan, Dunnet, SNK, Tukey and Scott-Knott) if the factor is qualitative. Or regression analysis if the factor is quantitative. To compare the additionals controls with the others treatments, the Dunnet test is used."

Usage

fatorial2.ad.dic(Dados,Protegido=FALSE,alfa=0.05,quali=c(TRUE,TRUE),verbose=TRUE,plot=2)

Arguments

Dados

Matriz contendo na primeira coluna a identificacao das testemunhas (tratamentos comuns deve ter valor "NA" ou zero). A segunda coluna deve ter a identificacao dos niveis do primeiro fator. A terceira coluna a identificacao dos niveis do segundo fator. A quarta coluna a identificacao das repeticoes. Na quinta coluna os resultados experimentais.
Protegido

Valor logico. Se for FALSE os testes de medias serao feitos indendente das significancias pelo teste F. Se for TRUE os testes de medias serao feitas apenas quando haver efeito significativo pelo teste F.
alfa

Valor indicando o nivel de significancia deve ser obrigatoriamente "0.001", "0.01", "0.05" ou "0.10" (default = 0.05).
quali

Vetor com dois valores logicos (TRUE/FALSE). TRUE indica que o respectivo fator e qualitativo, realizando-se o teste de medias. FALSE indica que o fator e quantitativo, sendo feita a analise de regressao.
verbose

Valor logico (TRUE/FALSE). TRUE apresenta os resultados da analise.
plot

Valor numerico indicando o grafico desejado para analise dos residuos:

  • 1: Residuals vs Fitted

  • 2: QQ-plot

  • 3: Scale-Location

  • 4: Cook's distance

  • 5: Histogram

Value

Retorna a comparacao multipla de medias obtida por varios testes para tratamentos qualitativos e regressao para testes quantitativos. O teste Dunnet e feito para comparar os tratamentos testemunhas com os demais.

Author(s)

Alcinei Mistico Azevedo, [email protected]

References

Canal no youtube -> Alcinei Azevedo - Dicas e aulas <https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK4wSzwg-IxvrzaNzSLLrXEB>

BANZATTO, D. A.; KRONKA, S. N. Experimentacao Agricola. 4 ed. Jaboticabal: Funep. 2006. 237 p.

GOMES, F. P. Curso de Estatistica Experimental. 10a ed. Piracicaba: ESALQ/USP. 1982. 430.

Examples

##Exemplo de experimento com duas testemunhas adicionais e fatores qualitativos

data(Dados3)
fatorial2.ad.dic(Dados3,Protegido=FALSE,alfa = 0.05,quali = c(TRUE,TRUE))

##Exemplo de experimento com uma testemunha adicional e um fator qualitativo
data(Dados4)
fatorial2.ad.dic(Dados4,Protegido=TRUE,alfa = 0.05,quali = c(FALSE,TRUE))

##Exemplo com tres testemunhas adicionais e um fator qualitativo
data(Dados5)
fatorial2.ad.dic(Dados5,Protegido=TRUE,alfa = 0.05,quali = c(TRUE,FALSE))